Отразить факт уплаты налога в бюджет третьим лицом за нашу организацию в 1С Бухгалтерия предприятия 3.0 можно с помощью документа Операция, введенная вручную (раздел Операции)
В Дебете проводки укажите счет расчетов по налогу, который оплачивает третье лицо, например, 68.07 Транспортный налог.
В Кредите проводки укажите счет расчетов с контрагентов-третьим лицом, который уплачивает за вашу организацию налог. Счет должен указываться тот, по которому имеется задолженность контрагента перед нашей организацией. В результате формирования Операции задолженность должна зачесться на сумму уплаченного налога.
Проверить задолженность можно через Оборотно-сальдовую ведомость по счету с отбором по контрагенту и группировкой по договорам и документам расчетов.
ОСВ по счету 62 после введения Операции: