Как в 1С:Бухгалтерия предприятия устранить переплату по зарплате

По счету 70 сальдо отсутствует.

Но в Расчетном листке на конец периода задолженность за работником остается.

Это вызвано тем, что при отражении выплаты зарплаты посредством документа Списание с расчетного счета или Расходный кассовый ордер с документом-основанием Ведомость (в кассу, в банк или на счета) программа производит движение не только по счетам, а еще и по зарплатным регистрам.

А возврат задолженности через ПКО с операцией Прочий приход произвел только движение по счетам.
Какие именно регистры задействованы, можно посмотреть по кнопке ДтКт в Ведомости и по кнопке ДтКт в документе уплаты (РКО или Списание с расчетного счета):

В Ведомости это

• Взаиморасчеты с сотрудниками (служит для отражения в Расчетном листке и т.п.)
• Зарплата к выплате (служит для заполнения Ведомостей).

В платежном документе это:

• регистр Бухгалтерские взаиморасчеты с сотрудниками (служит для отражения в Расчетном листке и т.п. при другой настройке).

Как исправить

Для того, чтобы убрать переплату, необходимо:

• Создать документ Операция, введенная вручную - с датой фактического возврата денег сотрудником и заполнить в нем данные этих трех регистров.

• По кнопке Еще - Выбор регистров - выбрать указанные регистры

Для этого можно закрепить окно снизу

А в верхней половине экрана показать движения документов Ведомость и документа уплаты и с операцией Расход повторить аналитику.  Сумму возврата указать отрицательную.
Взаиморасчеты с сотрудниками

Зарплата к выплате